奧塔哥大學有全新西蘭第一所醫學院，并且是南島的醫學研究中心，由于是第一個將試管嬰兒付諸實際的醫學中心，因此在世界上享有盛名。

　　奧塔哥大學也有全新西蘭唯一的牙醫學校，其國際排名更是在前十名內，且為大洋洲第一名。

　　奧塔哥大學也是南島唯一有藥學、理療、醫學實驗等科系的學校。這所醫學院至今依舊聞名，其入學的要求與一般大學相同，只要在大學入學考試中考過三個科目便能就讀，因此每年吸引近千名學生來此地就讀。

　　大家共修第一年科目，然后依成績決定往后的專業科系。醫學院每年錄取一百八十位學生，牙醫六十位，藥學約一百八十位。若未進任何理想科目的學生，可轉修其他科系，可用二年級成績重新申請牙醫或者是讀完一個學位后，重新申請學士后醫學院。

　　奧塔哥大學語言中心希望攻讀大學課程或者大學預科課程的學生提供強化英語和學習技巧的預科課程。語言中心是托福和雅思考試注冊中心，課程為考試提供專門準備課程。