馬來西亞國立大學學科廣泛，涉及到了文、法、醫、理、工等多個領域，其中馬來西亞國立大學本科專業涵蓋了心理學、傳媒、特殊教育、運動與娛樂、土木工程、聽力學、生物醫學、統計學等，碩士專業則包含了公共衛生、護理、營養學、法醫學、臨床藥學、伊斯蘭教法、神學與哲學、經濟學、會計等。
馬來西亞國立大學本科學科
人文與社科學院：心理學、傳媒、地理、發展科學、社會工作、英語研究
經濟與管理學院：會計、工商管理、經濟學、創業與創新、
伊斯蘭研究學院：伊斯蘭教法、神學和哲學、阿拉伯研究和伊斯蘭文明、宣教和領導力研究、古蘭經和圣訓研究
法學院：法學
教育學院：英語教育、特殊教育、運動與娛樂
計算機學院：計算機科學、信息技術、軟件工程(信息系統)、軟件工程(多媒體系統)
工程與建筑環境學院：土木工程、電氣與電子工程、機械工程、化學工程、建筑
科學技術學院：精算學、生物化學、生物信息學、生物學、化學技術、環境科學、食品科學與營養學、食品科學與商業管理、遺傳學、地質學、海洋科學、材料科學、數學、微生物學、核科學、物理學、植物生物技術、統計學
藥學院 - 吉隆坡校區：藥學
健康學院 - 吉隆坡校區：聽力學、生物醫學、影像診斷及放射治療、飲食學、環境健康、營養學、法醫學、職業療法、驗光、理療、言語科學
馬來西亞國立大學碩士學科
醫學院 - 蕉賴校區：公共衛生、護理(骨科和創傷學、助產學、心理健康、社區健康)、流行病學和統計、家庭健康、環境健康、職業健康、醫院管理與衛生經濟學、醫學教育、醫學社區工作、生物化學、解剖學、藥理學、生理學、寄生蟲學和醫學昆蟲學
藥學院 - 吉隆坡校區：臨床藥學、藥物分析
牙科學院 - 吉隆坡校區：理學碩士：牙科科學
健康學院 - 吉隆坡校區：健康教育、生物醫學、臨床營養學、臨床營養、臨床驗光、臨床心理
工程與建筑環境學院：環境工程、通信與計算機、建筑學、化學工程、機械工程、微電子工程、土木工程
法學院：比較勞動法和勞資關系、兒童法、家庭法、伊斯蘭金融體系、伊斯蘭刑法、憲法、知識產權法、信息技術法、公司犯罪法、國際海洋法、醫法、法律研究方法論、國際經濟法、公司法、性別與法律、證券法、貨物銷售法、行政法、國際貿易法、國際法與第三世界、破產法、國際人權法、競爭法、遺產法、旅游法、國際法與土著人民、移民法、國際發展法、死因裁判法、體育法、高級回教保險法、伊斯蘭安全法、證據法、水法
伊斯蘭研究院：伊斯蘭教法、神學與哲學、阿拉伯研究與伊斯蘭文明、達瓦與領導力、古蘭經和圣訓
教育學院：指導和咨詢、英語作為第二語言的教學 (TESL)、課程與教學法、特殊教育、馬來語教育、伊斯蘭教育、計算機教育、科學教育、商業與創業教育、幼兒教育、體育管理、教育行政、教育社會學、資源與信息技術、數學教育、阿拉伯語教育、歷史教育、經濟教育、文學教育、教育心理學、測量和評估
經濟與管理學院：經濟學、會計、創業與創新
社科與人文學院：英語語言研究、英語語言后殖民文學、東亞研究
信息科學與技術學院：軟件技術、網絡技術、高性能計算、人工智能、工業信息、信息科學、多媒體系統、信息系統
科學技術學院：應用物理學、化學、數學、統計數據、質量和生產力改進、生物學、昆蟲學、工程與環境地球物理學、工程地質、工業礦產、植物遺傳資源管理、環境評估和監測、海洋科學、植物系統學、輻射與核安全、能源技術、食物科學、科學營養、數據科學與分析
商學院：MBA
環境與發展研究院：發展與社會福祉、城市化、生態系統和景觀、可持續發展教育、環境治理、自然資源管理、有害物質和廢物治理、文化遺產、生物遺產、地質遺產、環境健康、災害管理、氣候災害、地質災害、技術災難；文學碩士：社會福祉、城市化、生態系統和景觀、可持續發展教育、環境治理、自然資源管理、有害物質和廢物的治理、文化遺產、生物遺產、地質遺產、環境健康
馬來世界與文明研究院：語言、文學和語言學、理論和馬來認識論、考古、歷史和馬來文化、馬來世界科技
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