馬來西亞私立大學碩士專業設置，相比于公立大學偏向于理論學科，私立大學專業主要以實踐就業為主，就以馬來西亞思特雅大學為例，該校碩士專業包含了管理營養碩士、應用科學碩士、建筑學碩士、藥物化學碩士、制藥技術碩士、藝術與設計碩士等等。
馬來西亞思特雅大學碩士專業
應用科學：管理營養碩士、應用科學碩士，通過研究、生物技術碩士、生物技術與商業管理碩士、食品科學與商業管理碩士
健康老化、醫學美學和再生醫學學院：健康老化，醫學美學和再生醫學碩士
醫藥科學學院：藥物化學碩士、制藥技術碩士、臨床藥學實習碩士
工程、技術和建筑環境學院：工程哲學碩士
建筑和建筑環境學院：建筑學碩士
創意藝術及設計學院：藝術與設計碩士
音樂學院：音樂碩士（表演研究）
商業與信息科學學院：MBA、MBA（Bluve Ocean戰略）、物流管理碩士、精算管理碩士
馬來西亞世紀大學碩士專業
1、MScM：管理學碩士Master of Science in Management，2年制。
方向有：英語教育、學前教育、特殊教育、教育管理、教育技術、小學教育、數學、教育評價、多元文化教育等。
2、MIT：信息技術碩士Master of Information Technology ，2年制。
方向有：軟件工程，硬件工程，計算機系統與網絡，大數據，網絡分析，云計算，機器人，無線網絡，網絡安全，黑客攻擊，多媒體信息系統，網絡技術，數據庫管理系統，人工智能，信息技術管理等。
3、MSc（Eng）：工程碩士Master of Science in Engineering，2年制。
方向有：機械工程，化學工程，電子電氣工程，土木工程，結構工程，工程設計，工程管理，水利工程，城市規劃、環境工程等。
4、MFP：財政金融碩士Mater of Financial Planning,1.5年制。
5、MA：會計碩士Master of Accountancy，1.5年制。
6、MACC：企業傳媒碩士MA in Corporate Communications，1.5年制。
7、以下專業畢業時，可獲得世紀大學和英國中央蘭開夏大學頒發的雙學位：
MBA：工商管理MBA-General Management，2年制。
MBA：國際商務MBA-Global Business，1.5年制。
MBA：金融MBA-Finance，1.5年制。
MBA：人力資源管理、市場學MBA- HRM/ Marketing，1.5年制。
信息技術學院：科技創業碩士
TERENGGANU校園：MBA（石油，天然氣管理）
社會科學和人文科學學院：兒童心理學碩士、臨床心理學碩士
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