作為一所正規大學，馬來西亞理科大學專業廣泛，涵蓋了計算機、會計、建筑、人文、教育等多個領域，具備本科、碩士、博士多階段課程教學。馬來西亞理科MQA認證的專業，MQA也就是馬來西亞學術鑒定局，目前馬來西亞理科大學所開設的課程均已被馬來西亞MQA認證，所頒發的學位文憑也都被各國教育部所認可。
馬來西亞理科MQA認證的本科專業
1、計算機：軟件工程 信息工程系統技術 多媒體處理 網絡處理 智能系統分布式計算機系統與安全
2、會計：會計
3、純理科：物理學 化學 數學 生物學（微生物、植物病理學、動物解剖學）
4、技術類：食品技術 環境技術 紙張及包裝技術 生物資源
5、應用科學；地球物理 工程物理 醫學物理 應用物理 分析化學 工業化學 操作研究 計算機模擬 數學模擬 數學與經濟 應用統計學 生物技術 農業生物 海洋生物 環境生物 植物病理學 傳染媒介與寄生物管理
6、房屋、建筑及規劃：建筑管理 建筑技術 城市地區規劃 建筑學 室內設計 測量
7、管理學：組織行為 市場學 操作管理 國際商務 金融
8、人文科學：英語語言學 馬來語學 地理學 文學 歷史 文科（翻譯與口譯）大眾傳媒 熒屏研究 誘勸性傳媒 新聞學
9、教育學：學科教育
10、社會科學：人類學和社會學 經濟學 社會工作 規劃和管理發展 政治學
11、藝術類：音樂 設計和新媒體技術 產品設計 圖像傳媒 美術 演繹與引導
馬來西亞理科MQA認證的碩士專業
1、MIXED MODE混合型：理碩士：原料工程、數學、統計、化學儀器、地理信息科學、旅游發展、綜合醫學、醫學研究、環境工程、建筑工程、電子系統設計工程、輸血科學、臨床解剖學、醫療統計學、醫科教育學。
文碩士：馬來語、文學、傳媒、翻譯員和英語研究、翻譯學
2、COURSEWORK MODE授課型：理碩士：計算機科學、信息科技、固體形態物理學、醫學物理、企業管理、設計、建筑科技
住宅學、建筑環境、旅游發展、電子系統設計工程、運動學、數學教學。
傳媒碩士：電影研究、新聞環境研究
工商管理碩士MBA，學費5.6萬人民幣
公共關系碩士
經濟管理碩士
藥劑學碩士（臨床藥劑學）
多媒體教育學碩士
教育碩士：課程研究、教育經營與管理、心理測試與教育評估、教育科學、英語教育/第二英語教學、教學技術、教育心理學、（對個人,社會以及心理等問題的）咨詢/指導。
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